在终端运行以下命令，然后注销，重新登录。

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gconftool --type boolean -s /desktop/ibus/panel/show_icon_on_systray true
gconftool --type boolean -s /desktop/ibus/panel/show true
gsettings set com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist "['all']"

PS，这个方法来自ubuntu 12.04系统托盘不显示ibus输入法图标的解决方法。我使用之后发现，不仅输入法图标出来了，原来一直没有图标的 Shutter 截图程序也能显示系统图标了。